山茱萸为常用中药。《中国药典》收载的山茱萸为山茱萸科植物山茱萸Cornus officinalis Sieb.et Zucc.［Macrocarpium officinale (Sieb.et Zucc.) Nakai］的干燥成熟果肉。

在历代本草和医籍方书中，大多是以“山茱萸”这个名称作为药用正名，这可能与《神农本草经》首载此名有关。但在其正名下，亦收载了许多别名，如蜀枣(《神农本草经》))，实、鼠矢、鸡足(《吴普本草》)，思益(《名医别录》)，汤主(《药谱》)，山萸肉(《小儿药证直诀》)，实枣儿(《救荒本草》)，肉枣(《本草纲目》)，山萸(《本草经读》)，枣皮(《会约医镜》)，萸肉(《医学衷中参西录》)，药枣(《四川中药志》)，红枣皮(《新华本草纲要》)等。山茱萸在历代医药文献中收载的别名虽然很多，但这些别名从两汉至明清近两千年间并未流传为常用名，医家处方多不采用，只是在医药典籍上相沿引用而已，真正在临床方药上如实、鼠矢、鸡足、思益、汤主之类的冷怪别名是寡闻罕见的。《金匮要略》的八味肾气丸、《千金翼方》的肾泄散、《小儿药证直诀》的六味地黄丸、《景岳全书》的左归丸、右归丸等著名方剂中的用名均取山茱萸这个传统的正名。

在上述很多的别名中，只有山萸肉这个名称自清末民初以来被广泛流传，这可能与《医学衷中参西录》中的用名有关，解放后在很多中医药专著中把山萸肉列为山茱萸的处方名，医药经营部门在中药材经营目录上把山萸肉列为山茱萸的商品名。